●2012年7月22日凌晨，当暴雨袭击北京的同时，昆明长水国际机场上千旅客滞留无法返回北京。在东航和长水机场各方的努力下，通过增补了7个航班，22日中午滞留长水机场的上千名北京旅客全部乘机返京。
微博上，不少网友直播了昆明前往北京的航班遭遇大面积延误后，部分旅客不满意航空公司和机场的服务。
●2012年8月5日19时，昆明长水国际机场遭遇雷雨天气，导致多个航班延误。其中，乘坐西部航空PN6106次航班由昆明前往重庆的旅客，由于长时间没有得到满意答复，在机场等待一夜之后，其中数十人于次日8时30分闯入昆明长水国际机场停机坪，希望借此引起相关部门的重视。
博主“倩云妹子”爆料称：“300余名重庆乘客于8月5日18时在昆明机场乘坐PN6106西部航空回重庆的航班，航班却被无故取消，迄今为止在机场滞留15个小时有余，昆明机场不给任何解释，在这期间未提供食物和帮助。”
乘客刘女士表示，他们采取闯入停机坪这一过激行为实属无奈，在候机厅等待近10个小时的时间里，旅客曾数次联系现场工作人员，但并未得到任何有效答复。
对于旅客滞留机场的原因，昆明机场管理方的解释为“天气原因导致的航班延误”。
●2012年11月29日，奥凯航空公司由昆明飞往长沙的BK2798航班，计划21时45分从昆明长水国际机场起飞，共有172名旅客将乘坐该航班前往长沙，但由于长沙白天大雾的原因，上一航段航班晚到，延误至次日凌晨00：02到达，导致106名旅客滞留昆明长水国际机场候机大厅拒绝登机，期间有少数旅客行为过激甚至殴打了工作人员。经过多方协调，终于使部分旅客于次日凌晨05：58乘坐该航班离开昆明飞往长沙，部分旅客被送到宾馆休息或改签其他航班，6名带头闹事和殴打工作人员的旅客被机场公安依法传唤。
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