不同种类的飞行模拟器，其作用也不尽相同。就训练用飞行模拟器而言，用它来进行飞行训练，有很多突出的作用。这主要表现在以下几个方面：
2.1 提高效率
用飞机训练飞行员，往往要受到飞机状况、机场情况及气象条件的制约，而且还要组织大批的指挥、通讯、机务人员及场务保障人员参加，效率较低。由于飞行模拟器装在室内，不受气象等条件的影响，也不需要大批保障人员，组织训练十分方便，而且可以长时间连续工作。例如，一架歼击机每年只能飞行200小时左右，而性能可靠的飞行模拟器每年可工作3000小时以上，有时每天可工作20小时。
在模拟器上训练，可对难度较大的驾驶动作和特殊情况处置反复进行练习，也可使飞行学员经常处于教员的直接观察指导之下，充分发挥教员的作用。有的模拟训练系统，一名教员可同时指导多名学员操作，更有效地利用了飞行教员的教学时间，加速训练过程。
飞行员经过在模拟器上训练之后，可以减少在飞机上的训练时间。美国飞行训练学院训练民航飞行员的情况表明，飞行员的改装训练至多只需5小时实际飞行，其它全部通过模拟器训练。DC--90飞机的改装训练，每个飞行员在飞机上的平均飞行时间只有2.1小时。我军某飞行学院试验表明，由于进行了模拟训练，在飞机上带飞次数约减少了五分之一。有些国家，在某种新飞机制造出来之前，先用该飞机的模拟器训练飞行员，当飞机配备到飞行部队时，飞行员就可很快地掌握它，从而争取了时间。这一点，在战争时期是具有特殊意义的。
2.2 节省经费
用模拟器训练飞行员，可以节省大量训练经费，这一点是显而易见的。其原因很多：
首先，一台功能较全的飞行模拟器，通常都比真飞机便宜得多，对于大型飞机尤其是这样。例如一台大型波音747飞机飞行模拟器的价格大约只有一架B-747飞机的1／4。
其次，用模拟器训练与用飞机训练相比，每小时直接消耗的费用要低得非常多。例如波音747飞机飞行1小时的直接费用约为1200美元，而在模拟器上每小时只需110美元。美国总会计局早在1973年就发表过一份报告,指出若把50％的中间训练和作战中队的飞行训练转移到模拟器上，那么每年就可节省9.1亿美元。使用模拟器训练还可节省大量航空燃料，这在当前世界能源普遍紧张的情况下，更具有重要的意义。我军某飞行学院曾于上世纪80年代在飞行训练阶段进行过模拟训练试点，仅16名飞行学员就节省飞行时间236小时，节约航油669吨，价值70多万元。
另外，由于模拟训练不需要大批导航、通信、机务、场务等保障人员，由此而节约的经费也是相当可观的。
2.3 保证安全
保证飞行安全，是飞行训练中头等重要的大事。用模拟器进行训练，就不存在发生飞行事故的问题，不会使飞行员的生命和飞机受到威胁。而且，飞行员还可在模拟器上反复练习各种故障及紧急情况(如发动机停车或失火)的处理方法。这样，在实际飞行中遇到类似情况，就可临危不惧，减少或避免发生飞行事故，保证飞行安全。
此外，模拟训练还有改善空中交通拥挤状况、减少环境污染……等优点。
正因为模拟训练有着无可比拟的优越性，因此世界各大航空公司60％～85％的飞行训练依赖于飞行模拟器，有的甚至已超过90％。从发展趋势来看，这种依赖程度还会更高。
另外，对于宇航员来说，模拟训练是必不可少的，尤其是在某种宇宙飞行器第一次宇宙飞行之前，是不可能在真实的飞行器上进行训练的，而只能先在模拟器上进行训练，然后才能进行实际的宇宙飞行。即使是能够进行多次飞行的航天飞机来说，也是不可能用真实的航天飞行来进行训练宇航员，因为这样做的代价实在太高了。
